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Kirgisistan ist ein Binnenland. Das Staatsgebiet erstreckt sich über etwa 900 km von Ost nach West und 410 km von Nord nach Süd.

Kirgisistan grenzt im Osten und Südosten an China, im Norden an Kasachstan, im Westen an Usbekistan und im Süden an Tadschikistan. Die Grenzen zu Usbekistan und Tadschikistan im Ferghana-Tal sind ziemlich unpassierbar. Eine der Folgen der stalinistischen Teilung Zentralasiens in fünf Republiken ist, dass viele ethnische Kirgisen nicht in Kirgisistan leben. Es wurden drei Enklaven geschaffen, die rechtlich zum Hoheitsgebiet Kirgisistans gehören, aber geografisch mehrere Kilometer voneinander getrennt sind: zwei in Usbekistan und eine in Tadschikistan.

Die Gebirgssysteme Tien Shan und Pamir dominieren das Relief von Kirgisistan, das zusammen etwa 65 % des Staatsgebiets einnimmt. Ein Teil des Alai-Kamms des Tien-Shan-Systems dominiert den südwestlichen Halbmond des Landes, und im Osten verläuft der Tien-Shan-Hauptkamm entlang der Grenze zwischen Südkirgistan und China und erstreckt sich dann weiter östlich bis zur Uigurischen Autonomen Region Xinjiang in China . Die durchschnittliche Höhe des Territoriums Kirgisistans beträgt 2750 Meter und reicht von 7439 Metern auf dem Gipfel des Sieges bis zu 394 Metern im Ferghana-Tal in der Nähe der Stadt Osch. Fast 90 % der Landesfläche liegen mehr als 1.500 Meter über dem Meeresspiegel.